主要审计重点污染防治项目的资金使用、工程管理与运行效益情况。在掌握污染防治项目总体进展情况（主要是项目资金落实、实际投资完成额和开工比例等）的基础上，检查项目资金使用与工程管理中有无严重违法违纪、重大损失浪费和工程质量隐患等问题。

一、项目资金管理情况

项目资金管理情况主要审计污染防治项目建设资金筹集、拨付、使用与结算情况，掌握水污染防治项目资金筹集、拨付的总体情况。重点关注和检查：各级政府是否及时足额筹集、拨付项目资金；主管部门和项目单位资金拨付、使用与结算过程中有无截留、挤占、挪用的问题；预付工程款结存较大的项目主管部门和项目单位有无利用关联企业套取建设资金，通过虚假的施工结算转移、侵吞资金；应付工程款结存较大的项目有无恶意拖欠工程款及拖欠原因。反映有无由于资金不落实等违纪违规问题导致未按期完成污染防治任务和水环境持续恶化的问题。

二、项目工程管理情况

项目工程管理情况主要审计主管部门和项目单位组织实施的污染防治项目，自立项审批到计划下达、设计与概算、招投标、工程款结算、竣工决算等工程管理全过程的情况。重点关注和检查：污染防治项目立项申报审批过程中有无重复申报、多头申报等虚报冒领的问题；有关部门批复概算内容是否明确，项目单位概算调整与执行是否符合国家规定，有无自行提高建设标准、扩大建设规模和变更建设内容问题；项目单位对设计、施工、采购、监理等是否实行招投标，施工企业中标后有无将工程违法分包或层层转包问题；项目竣工决算手续是否完备，财产交付使用是否及时，有无形成账外资产；有关部门在项目实施中的各类收费是否合规，有无乱收费、乱摊派。

三、项目运行效益情况

项目运行效益情况主要审计已投入使用的污染防治项目运行效益情况。重点关注和检查：有无因决策失误和管理不善造成重大损失浪费或工程质量隐患；污水（垃圾）处理设施是否达到设计能力，处理后的污染物是否达到国家规定标准；达不到设计能力的项目是否存在规划布局不当、配套管网建设不到位等问题。对采取BOT等市场方式运作的污染防治项目，重点审计项目业主变更后的国有资产权益维护情况，是否存在国有资产流失、给予BOT运营商固定回报的问题；地方政府或其控股的投资企业为BOT运营商或其他市场化运作企业违规担保等问题。

参考文献：

张庆龙:政府审计[M].上海:格致出版社,2010：197-198。